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E. coli 你真的了解吗?

您一直在努力设计一个理想的质粒——需要仔细挑选目的基因的最优启动子,并完美的克隆到空骨架中,确保给您的基因添加了正确的标签,甚至用IRES元件隔开下游添加的荧光蛋白。您为此付出了大量精力!那么让我们先花点时间来认识一下帮助您复制新质粒的小小原核生物:大肠杆菌。

E.coli 你真的了解吗?

本文将为您介绍常见的大肠杆菌菌株特性,以便帮您加以区分,并确定它们是否适合于您的质粒或进行您的实验。

  • History of E. coli  Strains

大肠杆菌是革兰氏阴性的棒状细菌,Dr. Theodor Escherich在1885年首次描述大肠杆菌并为它命名。大肠杆菌常见于动物肠道,天然的大肠杆菌菌株有很多种,其中一些对人类是致命的。现在多数实验室使用的商用大肠杆菌是由两个菌株分离出来的,K-12株和B株。K-12是在1920年从一名病人中分离出来的,最终成为常见的实验室菌株MG 1655及其衍生物DH5 alpha和DH10b。B株的历史较为复杂,它很可能是在1918年分离出来的,但在1942年第一次被命名为“B株”。BL 21菌株和衍生物是最常见的大肠杆菌B株。

  • Common E. coli  Strains Used in the Lab

可以发现今天大多数商业菌株都是为了一些特定的目的:快速生长,高通量克隆,常规克隆,克隆不稳定的DNA,制备非甲基化DNA,等等。许多突变使这些特征成为可能,并存在于大多数商业菌株中,尤其是那些能使质粒产量和/或DNA质量提高的突变。下面的表1列出了一些比较常见的大肠杆菌基因突变情况。

表1-大肠杆菌菌株常见的基因突变

此外,表2提供了快速了解一些流行菌株的信息,包括:他们的基因型,以及他们在实验室的主要用途。这些菌株都是基于大肠杆菌K-12,被定义为是生物安全一级菌株(BSL-1)。

 

表2-实验室大肠杆菌菌株

以上内容来源于addgene

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